Réponse trouvée sur le site de l'ambassade de Chine en France.
"Le titulaire du visa doit entrer en Chine avant l'expiration du visa et n'y séjourner légalement que pendant la durée de séjour indiquée sur le visa, calculée à compter de la date d'entrée."
Je bénéficie donc des 90 jours de mon visa à partir de ma date d'entrée.