Je pense que le carre bleu permet uniquement d'identifier les threads aucquels on as poste au moins un message, ca permet de suivre la conversation plus facilement.
Sinon la fonction N.messages se remet a 0 quelques fois alors qu'on as pas tout lu, du coup moi j'utilise
http://www.bonjourchine.com/search.php?do=getdaily pour avoir les messages des dernieres 24h.
Edit : au temps pour moi, on parlait pas du meme carre bleu !